É um dos mais característicos museus do Egipto. Está localizado no Bairro Antigo da cidade ou seja o Cairo Antigo ( Misr Al Qadima). Está ao lado da Igreja Colgada , dentro das ruínas da fortaleza antiga Romana babilónia. Inclui uma variedade de objectos e obras de arte Crista copta como frisos, trabalhos em pedra, obras em madeira, em marfim e metal, cerâmica, capitéis, obras plásticas, mármore, téxtil, pergaminhos manuscritos, pinturas, e iconos. As obras de construição iniciaram-se nos princípios do século XX, e acabaram em 1910 , graças a uma figura ilustre Cristã , chamada Mourcus Semeika Pasha quem estava a frente de uma comissão com outras personagens ricas e conhecidas da minoria cristã copta para fundar um museu específico dedicado enteiramente a conservar e expor obejectos cristãos coptas. E a partir de 1931 O museu passou a ser sob o controlo do estado    
 
O Museu Cóptico consta de dois compartamentos, o edifício antigo que foi construído inteiramente em 1910 e o compartamento novo que foi inaugurado em 1947. O prédio antigo consta de dois andares, cada um inclui 14 salas. Ao entrar o museo, o visitante consgue ver ruínas da fortataleza de babilónia, partes da torre antiga, o moinho de trigo, o forno ,e o depósito de ceriais. Os objectos no primeiro andar contêm uma colecção de estelas funerárias que datam do período entre o século IV e o Século XIII. Muitas dessas estelas contêm textos escritos na lingua copta, e decorações geométricas e vegetais junto aos emblemas do Cristianismo, as vezez estãp decoradas com cruzes e letras Coptas sobre tudo Alfa e Omega que simbolizam ao Início e o fim da vida. É curioso também encontrar umas estelas funerárias em que o difunto foi figurado segundo o seu tamanho natural asegurando uma vasa ou um conjunto de flores na sua mão.
                        
No segundo andar existe um conjunto fascinante de Frescos o que são pinturas realizadas com cores destemperadas em água sobre o   cal. Sempre que as abôbadas em cima dos santuários nas igrejas coptas estão recobertas com uma camada de gesso, e está decorada de pinturas religiosas, de Cristo, da Virgem, os anjos,os discípulos, os santos,os martiros, e outros temas bíblicos. O museu copta é famoso de objectos de madeira, os carpenteiros coptas eram espertos, usaram como os Antigos Egípcios madeiras nacionais como sicamoros, acacias, e palmeiras , e ao mesmo tempo usaram madeiras importdas como as madeiras de ébanos de Somália e do leste de África, Cidreiras de Líbano ,e pinos de Europa e do oeste de Ásia. O mais característico entre as obras em madeira é o trabalho de Mashrabiahas que eram usadas como janelas feitas de madeira pelos coptas e os muçulmanos. Essas Mashrabiahs estão compostas de numerosas pequenas partes de madeira talhadas e compstas impecavelmente para formar distintos desenhos geométricos e cruzes ou inscrições em árabe ou lingua copta. A composição desses elementos foi realizada sem cola. Também os tectos e as portas são feitas segundo este único estilo artístico.
                              

O Museu Cóptico  contém uma colecção de jarras de barro que eram usados nos mosteiros e as igrejas antigas para conservar licores sobre tudo o vinho usado nos rituais da missa. Essas jarras estão decoradas de cenas do ambiente egípcio como animais locais, aves, pombas, peixes do mar e do Nilo, sapos, cruzes, elemntos florais e vegetais, e também figuras de santos e monges , etc.
 
A pesar do florescimento da indústria do vidro na Era Copta o museu apenas contem um pouco conjunto de vidro, copos trasnparentes, frascos para o perfume, candelabros de cristal, e sobresalienta-se neste sentido este exemplo bonito que representa uma travessa de cristal proveniente da Igreja Colgada, e acredita-se que data do seculo IV.
 
O Edifício Novo que foi inaugurado em 2 de Fevreiro de 1947 inclui os seguintes departamentos :
           

*Os Objectos de pedras
*Epigrafias, manuscritos, e artigos de escrita.
*Obras em metal
*Téxteis.
*Ícones, e objeotos de marfim .
* A Biblioteca de Manuscritos.

As obras em pedra eram orginalmente partes de igrejas e mosteiros antigos arruínados. São partes e fragmentos arquitectônicos cujo formato inspirado em objectos florais e vegetais, animais, gemétricos, as vezes estão ornamentados de cenas de lendas gregas ou temas religiosas cristãs junto a cenas de caça no deserto.
 
No departamento dos íconos merece a pena ver um conjunto de iconos fantásticos e impresionantes que se carcaracterizam com a solemnidade e tranquilidade pois o artista copta em geral evitava ilustrar as cenas terríveis como por exemplo as cenas de tortura dos santos e mártires egípcios pela nova fé.
 
A biblioteca do museo contém quase 7000 livros e volumes, a maioria deles trata de temas de arte, lingua e a história da Igreja Copta no Egipto. Além disso contem um grande colecção de manuscritos, os mais imoprtantes são os que datam do século III d.C. conhecidos como “Os Papiros de Nag Hammadi” que tratam de dicotomias gnósticas.  Esses papiros foram descbertos com coicidência em 1945 numa aldeia que se chama “ Hamra Dom” perto da cidade de Nag. Hammadi, província de Souhag, no sul do Egipto, e isto aconteceu quando se surgirarm no mercado das antiguidades uns papiros, parcece que foram vendidos aos comerciantes de antiquidades no Cairo, e logo foram vendidos aos interessados nos estudos coptas na Europa e os Estados Unidos. Depois, o Departamento de Antiquidades do minstério de Cultura fez grande esforço para recolecta-los e hoje em dia estão conservados no museo Copta. Em 1970 Egipto e o Unesco nomeram uma comissão internacional para traduzir e estudar esses papiros, um trabalho que resultou em 11 volumes escritos em ingles sob o título de “The Coptic Gnostic Library”. O conteúdo desses papiros tratam de dicotomias e textos cristãos mixturados com paganismo e teorias filosóficas da era, o que mudou da visão dos estudiosos sobre o Gonosticismo naquela època ceda do Cristianismo.